Невероятно актуально в 90-е годы ХХ столетия звучали слова из завещания  Николая Петровича Пастухова: «Прошу детей моих жить в мире и согласии…». Как будто предвидел щедрый меценат и почетный житель города Ярославля ход событий на сто лет вперед…

 История Академии Пастухова начинается в смутные 90-е годы ХХ века, время, официально называемое перестройкой, а неофициально – периодом накопления первичного капитала. Старинное красивое здание, расположенное в центре Ярославля, с просторным и уютным внутренним двором привлекало внимание и силовых структур, и коммерческих, но дальше всех в попытке завладеть зданием бывшего Пастуховского училища пошла администрация Ярославской области во главе с губернатором Анатолием Ивановичем Лисицыным. Однако бывшее Пастуховское училище, в котором с 1972 года располагался Ярославский филиал Института повышения квалификации руководящих работников и специалистов химической и нефтехимической промышленности – ЯФ ИПКнефтехим, имело статус памятника, и приватизировать его в соответствии с законами было невозможно, поэтому все взоры желающих скорейшим образом обогатиться за счет приватизации обратились к другому зданию ЯФ ИПКнефтехим – общежитию гостиничного типа, расположенному по адресу: улица Республиканская, 79.